É o momento de começar a escalar na vida. Três anos depois das escolhas que ditaram seu rumo, Peter Parker está prestes a se formar no ensino médio. Mesmo que tenha seguido uma jornada de responsabilidades, Peter nunca se viu tão perdido quanto agora no caminho que deve seguir, sabendo que há uma vida além da máscara para construir, porém, ele pode superar a morte de seu tio Ben? Ou parte dele sempre será o menino que fez as escolhas erradas naquela noite? Ele não quer deixar sua tragédia lhe definir.
No entanto, quando Mary Jane Watson aparece em sua vida, o jovem presencia uma experiência que colocam seus pés ao chão mais uma vez, entendendo que enquanto a responsabilidade pode pertencer a aranha, o poder de agir pode lhe definir como adulto.

Marcada pelo Segundo Impacto, Tóquio III é atacada pelo Quinto Anjo, e o destino da humanidade fica nas mãos da Agência Especial NERV. Assim, Shinji Ikari se vê forçado a pilotar o robô EVA-01 e impedir que as criaturas destruam a tudo que ele conhece.

Rebuild de Evangelion é a principio um reconto da saga de Neon Genesis Evangelion, baseada na tetralogia de filmes, a história segue as mesmas fundações da jornada de Shinji Ikari, mas enfrentando uma curva que fará os eventos tomarem um novo rumo no confronto das Crianças na batalha contra os Anjos.

Durante o anime clássico, Seiya e Saori tem pequenos momentos para descobrirem um pouco mais de si, além de cavaleiro e deusa. Fragmentos entre a saga dos Cavaleiros Negros, saga dos Cavaleiros de Prata, saga das Doze Casas, Poseidon e Hades.