Após o desfecho do combate contra a Equipe Flare e Zygarde,Ash se encontra participando da cobiçada Liga Pokémon de Kalos,ainda em busca de realizar seu sonho de ser um Mestre Pokémon,mas ele mal sabe que esta sendo observado por uma misteriosa organização,cujo o objetivo é a dominação de todas as 5 dimensões existentes,porém o papel de Ash nesse objetivo ainda é desconhecido,junto de Serena,Clemont e Bonnie,Ash terá de enfrentar esses inimigos desconhecidos,tendo de demonstrar mais uma vez o poder de seus laços com seus Pokémon